Del ramo dei Colonna di Palestrina fu ucciso il 20 novembre 1347 assieme al figlio Giovanni, al figlio naturale Camillo, ad altri membri della famiglia Colonna e a numerosi baroni romani nel corso della cosiddetta battaglia di Porto San Lorenzo, quando le milizie baronali sotto il suo comando tentarono di entrare in Roma per abbattere il governo di Cola di Rienzo ma furono respinte con importanti perdite dalle milizie popolari. Stefano Colonna entrò in città per soccorrere il figlio ma fu colpito da una pietra al capo quando tentava di ritirarsi e quindi finito a terra.